Nat Biotechnol ：深度解读！科学家成功清楚地绘制出进化肠道的微生态系统目录！

近日，一项刊发在国际上杂志Nature Biotechnology上新书“A unified catalog of 204，938 reference genomes from the human gut microbiome”的资料系统性报告中所，来自国家分子生物学实验室等行政部门的科学家们通过资料系统性将人类所胃病原体一组中所所有存留的大肠杆菌真核生物概要成了一个大型的元资料，从而就能设法资料系统性医务人员全面性即使大肠杆菌基因和蛋白之间的相似性，以及其对人类所生活品质的影响。

大肠杆菌遍布化学物质内外，其并能产生核糖体来影响机体新陈代谢、生活品质和对性疾病的易感性，其如此普遍以至于化学物质病原体一组成员的数目要要强卵子还要多，包括大肠杆菌、霉菌和其它病原体；为了理解大肠杆菌在人类所生物学中所所扮演的关键反派，科学家们一般而言时会在实验室中所分离并对其指导，随后在对大肠杆菌展开DNA高通量，然而在此之前很多大肠杆菌还未在实验室的环境中所被指导繁殖。

为了拿到这些大肠杆菌的相关信息，资料系统性医务人员采取了另外一种步骤，他们从环境中所（比如胃）利用也就是说结果显示，随后在对整个结果显示中所的DNA展开高通量，然后利用计算机步骤对来自也就是说结果显示中所的数千种亚种的变异真核生物展开重建，这种步骤被称之为宏真核生物学技术，该技术能作为一种替代步骤对单个亚种的DNA展开分离和高通量。

资料系统性者Rob Finn表示，当年包括我们在内的三个独立团队重建了成千上万个胃病原体一组真核生物，而较大的缺陷就是这些团队所得到的结果应该具有可比性，以及应该能将这些结果概要成为一个比较全面的清单。在此之前资料系统性医务人员已经从人类所胃中所超过4600种大肠杆菌群落中所概要了20万个真核生物和1.7亿个核糖体序列，这种新型的元资料（独立的人类所上皮细胞真核生物不可数和独立的上皮细胞核糖体目录）揭示了机体胃的巨大多样性，并为进一步展开胃病原体一组资料系统性坚持不懈了高架桥。

资料系统性者绘制出重新这个巨大的目录是病原体一组资料系统性的一个历史性，未来会或将能为科学家们提供比较珍贵的资源来资料系统性人类所胃生态系统中所每一种大肠杆菌所扮演的关键反派。这项资料系统性表明，超过70%被检测到的大肠杆菌从而在实验室中所被成功指导过，而其在体内的活性即使如此未确定，而这类大肠杆菌中所较大的群体就是Comantemales；资料系统性者表示，看得见Comantemales如此广泛真是一个惊喜，这就凸显了我们的确对胃中所的大肠杆菌知之甚少，我渴望这个目录能设法生物化学家和微生物学家在未来会几年弥补这一知识空白。

该元资料/目录利用的所有资料都能在在线资源Mgnify中所拿到，其能设法科学家们系统性病原体的真核生物资料并且与当前的元资料展开对比；随着在世界上资料系统性团队不断发布重新元资料，该目录可能时会扩大到包括其它机体指甲的病原体一组，比如皮肤或口腔内部等指甲。就此资料系统性者表示，这一目录的概要未来会或为病原体学家和临床资料系统性医务人员提供比较丰富的资源，然而资料系统性医务人员可能时会在南美洲、亚洲和非洲等代表性不足的地区见到更多重新大肠杆菌亚种，在此之前资料系统性医务人员并不清楚不同青年人中所大肠杆菌多样性的差异和转变情况。

原始出新处：

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.